非淋菌性尿道炎是指由淋菌以外的其它病原体，主要是沙眼衣原体、尿素分解支原体所引起的尿道炎。本病目前在欧美国家已超过淋病而跃居性传播疾病首位。我国病例亦日益增多，成为最常见的性传播病之一。
    非淋菌性尿道炎的病因：40％～50％的非淋菌性尿道炎由沙眼衣原体引起。衣原体为介于细菌与病毒之间的细胞内寄生微生物，直径250～500nm，用显微免疫荧光测定法已测知衣原体至少有15种血清型，其中8型（D、E、F、G、H、1、J、K）已证实与尿道炎有关。衣原体不耐热，在室温中迅速丧失传染性，50℃30分钟即可将其杀死。30％的非淋菌性尿道炎由尿素分解支原体所引起，尿素分解支原体呈极微小的球杆状，直径仅为200nm，常寄生于人的尿道上皮，具有将尿素分解为氨的性能。能在细胞外独立生活，对外界环境抵抗力弱。45℃15分钟即可被杀死。10％～20%非淋菌性尿道炎可由其它病原体所引起。如滴虫、白色念珠菌、疱疹病毒、大肠杆菌、链球菌、金葡菌、人乳头瘤病毒、酵母菌、厌氧革兰氏阴性杆菌等。
    非淋菌性尿道炎的病因危害：非淋菌性尿道炎虽然症状较淋病轻，但危害并不比淋病轻。由于症状较轻，很多患者失去了治疗的最佳时期，从而使治疗非常困难，非淋菌性尿道炎危害十分严重。
    首先，有很强的传染性，如一个家庭一个人患有非淋菌性尿道炎的人，在一段时间内，可能会使性伴侣同时患上非淋菌性尿道炎，对下一代的影响也是非常大的。
    非淋菌性尿道炎如果长期医治不愈，反复发作，男性可自深层发展为前列腺炎，附睾丸炎。女性则可导致附件炎，不孕，流产，死胎新生儿感染等后遗症。
    此病为何久治难愈的原因很多，但因为目前治疗泌尿性疾病的诊所虽然很多，但一部分是没有专业性技术，没法给患者选择正确的治疗方案，滥用抗生素或用激素来缓解症状，患者产生对多种抗生素的耐药性及副作用，造成严重的经济负担而久治不愈。