很多疾病都是连贯的，一个小感冒的形成都伴随着咽喉部不适，流涕等等症状。因此口腔扁平苔藓的产生有时候也会带出一些其它的病症。因为口腔扁平苔藓是一种慢性浅在性炎症的黏膜角化性病变并且会伴有全身症状或者是疾病。扁平苔藓并发症主要是有：
    (1)神经系统症状：由神经系统症状者占20％～50％。表现为自主神经系统功能紊乱，精神紧张，失眠多梦，健忘等。从病史中多见精神创伤引起发病或使病情加重的病例。
    (2)消化系统症状：有消化系统症状的病人占10％～30％。表现为消化功能紊乱，或伴有肝、肾及十二指肠溃疡等疾病。
    (3)高血压：有高血压的病人占5％～10％，国外有人认为口腔扁平苔藓与高血压关系密切。
    (4)糖尿病：国外学者反响口腔扁平苔藓病人中13％同时患有糖尿病。我国资料显示患糖尿病的不超过5％，但临床上往往见到当血糖及尿糖增多时口腔或皮肤的病情加重。反之，当血糖得到控制后口腔及皮肤的损害多会减轻或愈合。
    (5)其他全身疾病：如心脏病、关节炎、泌尿系统疾病、女性月经不调、过敏、贫血等均有伴发，各在5％～10％。总之口腔扁平苔藓病人不伴发全身疾病仅在少数，低于10％。国内学者报道65例口腔扁平苔藓病人中有全身系统病163项，平均每人2～7种，少者1人1种，多的1人有9种全身病。只有5例无全身系统疾病。
    (6)化验检查：一般化验如学常规、血沉等均在正常范围内。部分病人血清中免疫球蛋白IgG、IgM呈升高趋势。用间接免疫荧光法检查血清中的抗核抗体有小部分病人呈阳性反应。用直接法检查活体组织可见部分病人呈炎性荧光反应。由上可知，口腔扁平苔藓可能伴有身体其他系统的疾病，有些可能是口腔扁平苔藓的根本原因。明确其伴随疾病有助于口腔扁平苔藓的全身对因治疗。
    近年国内外报道中经临床病理确诊为口腔扁平苔藓癌变的病例日益增多。容易发生口腔扁平苔藓癌变的病例往往具有特征性的先兆，主要表现为长期糜烂、溃疡不愈或可以愈合但在同一部位反复发生，疣状型基底变硬，白色斑块表面粗糙或呈绒毛状，萎缩型表面红亮等等。一般情况下位于舌腹及口底者如发生上述现象，应引起注意。一旦发现可疑迹象者，可用各种方法检查早期癌变。